Жизнь течет своим чередом, недавний союз всех деревень укрепился благодаря обмену помощи между деревнями. Но как ни прискорбно говорить, все хорошее заканчивается, так как и день подходит к своему окончанию. Очередной проблемой деревень стало сильное оживление Акацук, так называемых Преступников – S ранга. На этот раз у них план полностью изловить всевозможных джинчууриков. Но это не первая проблема деревнь. Странными стали новости о появлении организации, помысли которых никому не известны. Пошли слухи, что, возможно, они с Акацуками станут главными соперниками, а это врятли обойдется без последствий.
Где-то в глубине деревни Звука произошло, что-то странное, под покровом ночи, раздался сильный взрыв и появилась резкая вспышка света. После этого в Ото появился новый Отокаге, Саске Учиха. Свергнув Орочимару с престола, Саске сам занимает его. Но Орочимару ещё жив и вместе с Кабуто они пытаются отомстить Саске за предательство. А тем временем, Саске использует деревню в своих целях, найти и убить Итачи.